Bien que similaires, quoi que et quoique ont deux sens différents. Cependant, ils sont tous deux suivis par un verbe au subjonctif.

· quoi que peut être remplacé par quelle que soit la chose que/qui :

Exemple :        

Quoi que tu fasses, sois prudent.

Quoi que vous prépariez comme viande, vous pouvez l'accompagner de sauce.

· quoique peut être remplacé par bien que ou encore que :

Exemple :

Quoique je sois né en Espagne, je ne parle pas espagnol, car j'ai grandi ailleurs.

Vous devriez d'abord aller chez le boucher, quoiqu'il ferme à midi.

Remarque :
Employé seul et suivi de points de suspension, quoique exprime le doute quant au fait énoncé précédemment.

Exemple :
Je ne pense pas aller à la soirée, quoique...